2009

    PN II ID-2325/2009-2011: Impactul uman asupra ecosistemului subteran: analiza factorilor abiotici si biotici prin utilizarea unor metode de microbiologie si genetica moleculara, cu implicatii in conservare, Derulare 2009-2011.
        Responsabil proiect: Dr. Daniela Borda

2008

    PN II MIGRELEMENT 32112/2008: Studiul migrarii unor elemente in structurile acvifere din zona amplasamentului viitorului depozit final de deseuri slab si mediu active Saligny.
        Responsabil proiect: Dr. Constantin Marin

    PN II EPIKARST: Cooperari bilaterale: Fauna în apa de percolatie din pesteri ca indicator a poluarii de suprafata.
        Responsabil proiect: Dr. Oana Moldovan

2007

    PN II SPANRO NAT 2000: Fundamentarea stiintifica a unui model de implementare a legislatiei Natura 2000 in Romania, luand ca studiu de caz speciile de animale listate in Directiva Habitate 92/43/EEC (partener).
        Responsabil proiect: Dr. Eugen Nitu

    PN II MODEL-ACVASUB 31-032/2007: Modelarea impactului metalelor grele asupra acviferelor prin studiul complex al faunei acvatice subterane si monitorizare in sistem GRID.
        Responsabil proiect: Dr. Oana Moldovan

2006

    CEEX NATFORMAN 59/2006: Structura si dinamica ecosistemelor forestiere naturale, suport pentru fundamentarea de masuri silviculturale apropiate de natura si pentru o gestionare durabila a padurilor (partener).
        Responsabil proiect: Dr. Eugen Nitu

2005

    CEEX CLIMKARST 627/2005: Variatii climatice rapide inregistrate in depozitele carstice din Romania, evidentiate de indicatori izotopici si paleomagnetici.
        Responsabil proiect: Dr. Silviu Constantin

    CEEX TAXFILMOL 82/2005: Diversitatea genetica, taxonomia si filogenia unor specii problema din flora si fauna Romaniei studiate prin metode morfologice si moleculare (partener).
        Responsabil proiect: Dr. Daniela Borda

2008

    CNCSIS 31/2008: Arhive climatice in carst - o abordare integrata pentru studierea si modelarea oscilatiilor climatice rapide.
        Responsabil proiect: Dr. Silviu Constantin

2007

    CNCSIS 1244/2007: Studiul mecanismelor de transfer al unor poluanti in mediul carstic.
        Responsabil proiect: Dr. Constantin Marin

    CNCSIS 1150/2007: Modelarea complexa a transferului poluantilor in zona de ecoton epicarstica.
        Responsabil proiect: Dr. Oana Moldovan

    CNCSIS A-376/2005-2007: Utilizarea secventelor genice alaturi de analiza mofologica si ecologica complexa în elucidarea unor probleme de taxonomie si evolutie moleculara din cadrul diversitatii criptice a chiropterelor.
        Responsabil proiect: Dr. Ruxandra Bucur

    CNCSIS A-375/2005-2007: Structura, rolul functional si modalitati de conservare a biodiversitatii unor ecosisteme acvatice naturale, transformate si create, comparativ in ape curate si in ape poluate.
        Responsabil proiect: Dr. Daniela Borda

2006

    CNCSIS 723/2006: Vulnerabilitatea terenurilor carstice si asociate din Romania. Stabilirea criteriilor si evaluarea terenurilor.
        Responsabil proiect: Dr. Cristian Goran

2007

    GAR 98/2007: Schimbari climatice majore in intervalul Pleistocen mediu–Actual bazate pe dinamica asociatiilor de mamifere din sud-estul Romaniei. Geocronologie, paleomedii, corelatii cu eventuri globale.
        Responsabil proiect: Dr. Emanoil Stiuca

    GAR 87/2007: Reconstructia ecologica a habitatului subteran din pestera Cioclovina Uscata, cu privire speciala asupra biodiversitatii sitului in context paleoclimatic.
        Responsabil proiect: Dr. Alexandru Petculescu

    GAR 82/2007: Utilizarea speciilor endemice in biogeografia istorica si delimitarea arealelor carstice de protectie in Carpatii de Vest.
        Responsabil proiect: Dr. Oana Moldovan

    GAR 80/2007: Modelarea variatiei structurii si activitatii comunitatilor microbiene din biofilmele de la interfata apa termala sulfuroasa–aer, in conditiile acviferului de la Mangalia (Pestera de la Movile).
        Responsabil proiect: Dr. Alexandra Hillebrand